«ریو ۲۰۹۶: یک داستان عاشقانه و خشمگین» یک انیمیشن سینمایی است که عشق میان یک قهرمان جاودانه و ژاناینا را به تصویر می‌کشد؛ زنی که او به مدت ۶۰۰ سال عاشقش بوده است. به عنوان پس‌زمینه این داستان عاشقانه، فیلم چهار دوره از تاریخ برزیل را برجسته می‌کند: استعمار، برده‌داری، رژیم نظامی و آینده در سال ۲۰۹۶، زمانی که جنگی بر سر آب در خواهد گرفت.

پس از سقوط هواپیما، سای، یک میمون کپوچین که در اسارت متولد و بزرگ شده است، خود را در جنگل‌های وحشی آمازون تنها و گم‌شده می‌بیند.