داستان این فیلم جذاب درباره "ویلی وانکای" جوان می‌باشد که مملو از ایده های مختلف و مصمم به تغییر جهان به مکانی دلپذیر است. این فیلم داستان شگفت‌انگیزی را روایت می‌کند که چگونه بزرگترین مخترع، شعبده‌باز و شکلات‌ساز جهان، به ویلی وانکای محبوبی تبدیل شد که امروز می‌شناسیم و ...

پدینگتون که توانسته است پس از گذراندن ماجراهای قسمت اول در خانواده‌ی براون جایگاهی برای خودش پیدا کند ، اکنون در تلاش هست تا با انجام دادن شغل‌های مختلف پولی پس‌انداز کند تا هدیه‌ای ویژه برای جشن تولد 100 سالگی عمه‌اش بتواند بخرد. اما…

خرسی در جستجوی خانه­ ای برای خود، به لندن سفر می ­کند. اما بعد از گم شدن و تنها ماندن در ایستگاه پدینگتون ، با خانواده ی مهربان براون ، که بهشتِ موقتی را به او عرضه می­ کنند ، آشنا می‌شود و …