فیلم «بازرسی بدنی» چندین داستان موازی را دنبال میکند که به بررسی آزادیهای فردی در مقابل امنیت ملی در دوران پس از حملات ۱۱ سپتامبر میپردازند؛ دو خط داستانی اصلی شامل یک زن آمریکایی بازداشتشده در چین و یک مرد عرب بازداشتشده در شهر نیویورک است.